Au milieu de la Cinquième Guerre du Saint Graal, Caster met ses plans en mouvement, en commençant par la capture du Sabre Serviteur de Shirou. Avec la sorcière de plus en plus puissante, Rin et Archer déterminent qu’elle est une menace qui doit être traitée immédiatement. Mais alors que l’équilibre du pouvoir dans la guerre commence à changer, le Maître et le Serviteur se retrouvent à marcher séparément. Pendant ce temps, en dépit de perdre son serviteur et trébucher de blessures, Shirou ignore l’avertissement de Rin d’abandonner la bataille royale, forçant son chemin dans le combat contre Caster. Déterminé à montrer sa détermination dans sa volonté de se battre, le potentiel de Shirou à devenir un protecteur du peuple est mis à l’épreuve. Au milieu de l’effusion de sang et du chaos, les motivations de chaque Maître et Serviteur sont lentement révélées alors qu’ils sacrifient tout pour s’élever en tant que vainqueur et réclamer le Saint Graal.