En surface, le lycée Koudo Ikusei est une utopie. Les élèves jouissent d’une liberté sans précédent, et il est classé très haut au Japon. Cependant, la réalité est loin d’être idéale. Quatre classes, de A à D, sont classées par ordre de mérite, et seules les classes supérieures reçoivent un traitement favorable. Kiyotaka Ayanokouji est un élève de la classe D, où l’école déverse son pire. Là, il rencontre l’insociable Suzune Horikita, qui croit qu’elle a été placée dans la classe D par erreur et désire grimper jusqu’à la classe A, et l’idole de classe apparemment amicale Kikyou Kushida, dont le but est de se faire le plus d’amis possible. Bien que l’appartenance à une classe soit permanente, les classements de classe ne le sont pas; les élèves des classes inférieures peuvent augmenter dans les classements s’ils obtiennent de meilleurs résultats que ceux des classes supérieures. De plus, dans la classe D, il n’y a pas de barres sur les méthodes qui peuvent être utilisées pour avancer. Dans cette école impitoyable, peuvent-ils triompher contre toute attente et atteindre le sommet ?