Au cours de la dernière bataille l'Axe, le pouvoir de contrôler les titans, a été révélé au grand jour. Apprenant cela, le gouvernement dépêche les Brigades Spéciales de capturer vivant Eren et Christa / Historia, la fille incestueuse du souverain. C'est néanmoins sans compter sur l'esprit de rébellion du bataillon qui a déjà beaucoup trop sacrifié dans sa recherche de la vérité. Ainsi, les soldats de la liberté, emmenés par Erwin, prévoient de renverser le trône manu militari au nom du salut de l'humanité. C'est une bataille d’une toute autre envergure que vont devoir livrer nos héros car l'ennemi n'est plus un monstre de quinze mètres de haut mais un escadron d'hommes dirigés par le sinistre Kenny Ackerman dit "l'Égorgeur", un tueur en série et ancien mentor de Livaï...