Malgré les nombreux défis qu’il a surmontés jusqu’à présent, la mission de Shidou Itsuka avec Ratatoskr est loin d’être terminée. En s’éloignant de sa routine quotidienne, Shidou rencontre une femme affamée allongée dans la rue et finit par l’aider. Après leur arrivée à son appartement, la femme se présente sous le nom de Nia Honjou, une artiste de manga populaire qui travaille sous un pseudonyme. Cependant, allant droit au but, Nia révèle qu’elle est aussi un Esprit et est consciente de l’opération secrète de Shidou. Intéressée à voir son charisme de première main, Nia défie Shidou pour la conquérir à un rendez-vous. Alors qu’il cherche une occasion de sceller ses pouvoirs, Shidou en apprend plus sur Nia et son histoire avec Deus Ex Machina Industries, un nom qu’il connaît bien...