Les esprits sont des entités surnaturelles avec un immense pouvoir, capables de créer des tremblements spatiaux chaque fois qu’ils apparaissent. Une façon de traiter avec eux est par la force brute et les tuer... ou les faire tomber amoureux et sceller leurs pouvoirs. Après avoir scellé trois Esprits, Shidou Itsuka continue sa mission avec Ratatoskr en localisant plus d’esprits et en les datant, pour assurer la sécurité du monde contre toute autre destruction. Cependant, cette fois-ci, leurs problèmes ne seront pas limités aux Esprits car une menace plus imposante semble avoir remarqué leurs activités.