Quand un démon métamorphe avec une soif de chair humaine, connu sous le nom de "youma", arrive dans le village de Raki, une femme seule aux yeux argentés entre en ville avec seulement une épée sur le dos. C’est une "Claymore", un être fabriqué à moitié humain et à moitié youma, dans le but exprès d’exterminer ces monstres. Après la mort de la famille de Raki, le Claymore lui sauve la vie, mais il est ensuite banni de sa maison. N’ayant nulle part où aller, Raki trouve la Claymore, connue sous le nom de Clare, et décide de la suivre dans ses voyages. Alors que le couple voyage de ville en ville, en battant youma le long du chemin, plus d’informations sur l’organisation de Clare et ses compagnons guerriers viennent à la lumière. Avec chaque ville nettoyée et chaque démon détruit, ils se rapprochent de la youma sur laquelle Clare a cherché vengeance depuis qu’elle a choisi de devenir une Claymore.