Il y a dix ans, une éruption volcanique a mené les îles Ayaka du Japon au bord de la destruction. Depuis lors, Yukito Yanagi a vécu avec des familles d’accueil sur le continent, mais il s’est isolé des autres à la suite d’un incident troublant. En raison des souhaits de son défunt père, Makoto, Yukito est ramené à son lieu de naissance le jour de son diplôme d’études secondaires. Là, il rencontre les disciples de Makoto et apprend l’état surnaturel de la région. Des formes de vie mystérieuses connues sous le nom de Mitama habitent les îles, mais leur potentiel à se nourrir de l’énergie négative des humains et à se transformer en monstres féroces appelés Ara-Mitama met en danger la vie des insulaires. Yukito découvre que, comme son père, il est un Ley Master, un individu spécial avec des capacités proches de la magie, chargé de pacifier l’Ara-Mitama. Alors qu’il apprend à surmonter son traumatisme et à contrôler ses pouvoirs, Yukito décide de suivre les traces de son père et de devenir un Ley Master de premier ordre pour protéger la paix d’Ayaka.