Après avoir réussi son examen de licence provisoire de héros, Izuku "Deku" Midoriya cherche à faire un stage extrascolaire dans une agence de héros professionnels. Sur la recommandation de son mentor All Might, Midoriya obtient un poste auprès de l'ancien acolyte d'All Might, Sir Nighteye, qui est désormais un héros célèbre à part entière. Tandis que les camarades de classe de Midoriya développent leurs propres capacités grâce à divers stages, le méchant Kai Chisaki utilise ses pouvoirs terrifiants pour s'attirer les faveurs du monde criminel. Connu sous le nom d'Overhaul, les ambitions de Chisaki se heurtent à la League of Villains et à son chef, Tomura Shigaraki. Grâce à son travail avec Sir Nighteye, Midoriya découvre le syndicat du crime de Chisaki et la relation hostile du méchant avec une mystérieuse jeune fille nommée Eri. Craignant pour la sécurité de l'enfant, Midoriya et son camarade Mirio Toogata doivent travailler ensemble pour mettre fin au règne de terreur de Chisaki.