En désespoir de cause, Edward Elric a sacrifié son corps et son âme pour sauver son frère Alphonse, et est maintenant déplacé au cœur de Munich, en Allemagne. Il peine à s’adapter à un monde qui lui est complètement étranger à la suite de la crise économique qui a suivi la fin de la Première Guerre mondiale. Isolé et incapable de rentrer chez lui avec ses compétences alchimiques, Edward continue de rechercher d’autres méthodes pour échapper à la prison aux côtés de collègues qui ressemblent à beaucoup de personnes qu’il a laissées derrière lui. Alors que la dissidence se répand parmi les citoyens allemands, ses voisins ressentent également l’agitation de la nation humiliée. Pendant ce temps, Alphonse continue d’enquêter sur la disparition d’Edward, plongeant dans la science de l’alchimie dans l’espoir de retrouver enfin son frère aîné.