La saison 3 de Wakfu a été diffusée à partir du 2 septembre 2017. Un an et demi, depuis leur combat titanesque contre les Dragons Primordiaux et Ogrest, Yugo, Tristepin et les membres de la Confrérie du Tofu mènent leur vie chacun de leur côté : Amalia se préoccupe du Royaume Sadida ; Evangelyne, de nouveau enceinte, et Tristepin élèvent leurs enfants Elely et Flopin ; quant à Ruel, il n’est jamais très loin de Yugo. Le jeune Eliatrope est à la recherche de son frère dragon, Adamaï, mais celui -ci a rejoint la Fratrie, une organisation aux desseins obscurs, dirigée par l’énigmatique Oropo. L’enlèvement d’Evangelyne et de Flopin signe la fin de l’accalmie pour la Confrérie du Tofu, qui part à leur poursuite sans se douter qu’ils vont devoir passer par de nouvelles épreuves. Et si l’avenir d’un autre monde reposait désormais sur leurs épaules ?