Les Ombres, caractérisées par leur apparence noire et leur tendance à émettre de la suie lorsqu’elles sont agitées, sont une famille de nobles qui résident dans un manoir colossal au fond des montagnes loin des autres humains. Lorsqu’un enfant de l’ombre est presque majeur, on lui attribue une poupée vivante qui agit non seulement comme son accompagnateur, mais aussi comme sa seconde moitié, les visages qu’il aurait pu avoir sans son teint. Emilico est une poupée joyeuse, nouvellement créée qui sert un maître plutôt doux nommé Kate. Malgré leur différence de personnalité, Emilico fait ce qu’elle peut pour répondre aux besoins de son maître. Alors qu’elle en apprend plus sur son rôle et son devoir, Emilico commence à rencontrer ses camarades Dolls et leurs maîtres respectifs et en apprend davantage sur le but de son existence. "Ne vous inquiétez pas pour les choses triviales", dit l’une des règles que toutes les poupées doivent respecter. Mais comment la toujours curieuse Emilico pourrait-elle le faire face aux secrets profonds de la Maison des Ombres ?