Malgré la récente attaque d’Akuma, les membres de l’Ordre Noir sont de bonne humeur alors qu’ils s’apprêtent à déménager vers une nouvelle base. Dès son arrivée, cependant, Allen Walker est soudainement appelé par l’Agence centrale et a son bras scellé de force par l’Ordre. Il est ensuite conduit à une rencontre surprenante avec son maître, le général Cross Marian, qui révèle des secrets stupéfiants entourant l’énigmatique 14ème Noé. Un incident de voleur fantôme, l’arrivée d’un mystérieux groupe d’exorcistes, la mort d’un camarade important et une bataille totale contre la famille Noah — qu’est-ce que cela signifie pour Allen, Yuu Kanda et le reste de l’Ordre? Ce n’est que le début d’une série d’événements étranges, apparemment non liés qui mènent à quelque chose de beaucoup plus grand.